O serie de factori, cu precădere antropici sau de origine antropică au cauzat proliferarea vectorilor diferiților agenți patogeni. Dintre acești factori amintim schimbările climatice, schimbarea utilizării terenurilor, modificarea practicilor zootehnice, despăduririle, irigațiile și planificările hidrologice și multe altele. La toate acestea se adaugă creșterea rezistenței vectorilor agenților patogeni la acțiunile de control chimic respectiv creșterea și accelerarea circulației transcontinentale.
Delta Dunării, fiind zona de reproducere sau doar de migrație a milioane de păsări migratoare, este principala poartă de intrare în România a unei serii impresionante de agenți patogeni. Rolul Departamentului va fi de îmbunătățire a cunoașterii ecologiei vectorilor și speciilor rezervor, a agenților patogeni ce produc boli transfrontaliere, emergente și zoonotice în ecosistemele din Rezervația Biosferei Delta Dunării și împrejurimi.
Valorificarea rezultatelor cercetărilor Departamentului se va face prin fundamentarea ştiinţifică necesară pentru ANSVSA, DSVSA – Tulcea, Direcția de Sănătate Publică, ARBDD și ministerele de resort în legătură cu Directiva 2003/ 99/CE a Parlamentului European și a Consiliului privind monitorizarea zoonozelor și a agenților zoonotici. De asemenea, vor fi oferite informații din timp cu privire la prezența unor agenți patogeni, vectori sau specii rezervor implicate în transmiterea și amplificarea unor boli infecțioase oferind astfel posibilitatea ca autoritățile să declanșeze planurile de contingență.